1.怎么处理require.js这些不需要被合并的东西

所有appDir中的文件都会先copy到dir文件中，进行压缩，然后根据build.js中的配置进行相应的合并，包括img等；

2.样式合并后原来单独的模块是不是也还在？

是的，还在

3.config.js与build.js的同步问题

需要同步paths和shim配置

4.baseUrl是相对谁来说的？build.js与config.js里的baseUrl对应关系？

config.js里的baseUrl默认是相对于加载require.js的页面；

build.js里的appDir是相对于build.js所在的路径，baseUrl相对于appDir；

当buildjs里有appDir时，相应的baseUrl可省略掉appDir这一层？

是的，可以，实际url=appDir+baseUrl+path

5.如何减少js请求数？即将某个js中所有require到的js都合并到这一个js中。

在build.js里的modules中进行相关配置，有配置的module会合并成一个js文件；

参考：http://requirejs.org/docs/optimization.html